Изменения в генной активности можно будет использовать в криминалистике для точного определения времени смерти жертвы преступления, биоинформатики разрабатывают для этого специальную программу - Гранит науки - 2018-02-20

Ведущий автор исследования, которое позволит уточнять биологические параметры преступлений, биоинформатик Родерик Гуиго (Roderic Guigó) из Центра геномной регуляции (Centre for Genomic Regulation) в Барселоне, Испания, участвует в международном проекте по изучению экспрессии тканевых генотипов (Genotype-Tissue Expression, GTEx). Это консорциум, который определяет активность генов в тканях сотен людей, как живых, так и умерших. Цель проекта в выяснении механизмов, обусловливающих формирование в одном организме при одной и той же последовательности ДНК разных клеток с разными функциями. Но кроме того стоит задача в понимании того, каким образом небольшие вариации в ДНК разных людей могут влиять на то, что делают клетки. Поскольку ранее другими исследователями уже было показано, что некоторые гены сохраняют активность спустя четыре часа после смерти организма, Гуиго решил выяснить, как меняется такая посмертная генная активность со временем. Результаты, полученные его группой, опубликованы в журнале Nature Communications. «Реакция организма на смерть достаточно тканеспецифична», поясняет ученый в комментарии изданию Sciencemag.org. Например, генная активность в головном мозге и селезенке со временем меняется не сильно, но экспрессия более 600 генов, работающих в мышцах, сразу после смерти либо повышается, либо резко снижается. Гуиго с коллегами проанализировали 9000 образцов из 36 тканей, про которые были точно известны и время смерти донора и продолжительность хранения материала.

Затем авторы стали разрабатывать программу, которую научили распознавать особенности 399 человек. После чего они проверили, насколько точно машинное обучение может предсказать время смерти 129 других индивидуумов. И программа обнаружила, например, что в крови после смерти резко снижается активность генов, участвующих в синтезе ДНК, иммунном ответе и метаболизме, но при этом повышается экспрессия генов стрессового ответа, и все это позволяет установить время смерти в пределах шести часов. Большая часть изменений генной активности – как повышение, так и снижение – приходится на интервал между семью и 14-ю часами после смерти. После 14 часов она стабилизируется. Представленная компьютерная программа – это первый шаг на пути вовлечения генной активности в судебную экспертизу, «и в этом смысле она может рассматриваться как академическое упражнение, показывающее, что показатели генной активности могут передавать информацию о времени смерти», говорит Гуиго. Новости мировой науки вы найдете также на странице нашей программы в газете научного сообщества «Поиск».