Новый древний геном человека обнаружил связь сибирского «денисовца» с испанскими протонеандертальцами - Гранит науки - 2013-12-11
Чем точнее читается ДНК, тем более запутанной предстает история человечества.
Известный палеогенетик Сванте Пээбо (Svante Pääbo) из Института эволюционной антропологии Макса Планка в Лейпциге (Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology in Leopzig) на протяжении нескольких лет пытается отследить генетические связи загадочного вымершего человеческого вида из алтайской пещеры Денисова. По фрагментированным останкам трех особей был восстановлен геном этого гоминина, и выяснено, что он оставил генетический след в ныне живущих юго-восточных азиатах.
Пээбо ожидал обнаружить признаки денисовской ДНК и в других частях Азии, но вместо этого нашел их в генетическом материале из костных останков протонеандертальцев, обитавших на территории Испании. Статья об этом появилась в последнем номере Nature. Техническое достижение опубликованной работы, которую выполнил сотрудник Пээбо Матиас Мейер (Matthias Meyer), в том, что почти полный митохондриальный геном расшифрован по образцу митохондриальной ДНК, выделенной из осколка бедренной кости, которой от 300 тысяч до 400 тысяч лет. Это старейшая из прочитанных на сегодняшний день последовательностей ДНК человека, она в три или даже в четыре раза старше предыдущего рекордсмена по древности расшифрованной молекулы наследственности, ДНК, выделенной в 2006 году из костей неандертальца и прочитанной в 2009-м.
Кость, сохранившая генетический материал с особенностями «денисовского» человека, была найдена горах Атапуэрка в месте под названием Sima de los Huesos, что означает «Яма с костями». Здесь очень много ископаемых останков, в числе которых более шести тысяч костей от 28 индивидуумов. Палеонтологи классифицировали их как Homo heidelbergensis, этот человеческий вид обитал на территории Европы, Африки и Азии от 600 тысяч до 250 тысяч лет назад и дал начало не только неандертальцам, но, возможно, также Homo sapiens.
Для выделения и анализа столь древней ДНК Мейер с коллегами разработали новый метод секвенирования единичных коротких – от 35 до 45 пар оснований - цепей ДНК. Чтобы избавиться от загрязнений современной ДНК они анализировали только те сегменты ДНК, что содержали урацил. Обычно это основание встречается у РНК, но оно может быть и индикатором древности ДНК: при деградации этой молекулы в урацил превращается цитозин, одно из четырех нуклеотидных ДНК-овых оснований. Определение возраста расшифрованной ДНК по скорости мутаций, известных для современного человека, показало совпадение с датировкой останков другими методами. Это 400 тысяч лет. Как могли в геноме гоминин, обитавших на территории испанского археологического места Атапуэрка (авторы называют этих людей Sima) оказаться редкие признаки «денисовского» человека, жившего на расстоянии в 7500 километров – это большой вопрос.
Для объяснения столь неожиданного открытия авторы предложили несколько сценариев. Возможно, протонеандертальцы из Атапуэрка скрещивались с очень ранними денисовцами и позаимствовали их митохондриальную ДНК. Или же «денисовская» митохондриальная ДНК – это след еще более древней линии гоминин, например, Homo erectus. Таким образом и люди Sima, и поздние денисовцы могли унаследовать эту архаичную митохондриальную ДНК от общего предка. Поздние неандертальцы и современные люди также могли ее унаследовать, но после утратить. История человечества «становится все загадочнее и загадочнее», сказал в комментарии для Science NOW палеоантрополог Иан Таттерсол (Ian Tattersall) из Американского музея истории естествознания (American Museum of Natural History) в Нью-Йорке. Новости мировой науки вы найдете также на странице нашей программы в газете научного сообщества «Поиск».