Черная смертью умерла - Гранит науки - 2011-09-07

Возбудитель чумы, которая в Средние века называлась Черной смертью (Черным мором), возможно, прекратил свое существование – на это указывает геномный анализ древней бактерии чумной палочки

От чумы, тяжелейшего инфекционного заболевания, которое вызывает бактерия Yersinia pestis, ежегодно умирает не менее 2000 человек. Т.е. сама чума никуда не делась, но, судя по опубликованным недавно данным одного исследования, нынешний штамм чумной палочки отличается от того, что уносил десятки миллионов жизней в Средние века. Тот штамм, возможно, исчез бесследно. Хендрик Пойнар (Hendrik Poinar), эволюционный генетик из канадского Университета МакМастера (McMaster University) вместе с коллегами годами пытались изучить возбудителя Черного мора по ДНК бактерии, однако получение пригодных для анализа образцов было нелегкой работой. Ученые имели дело с останками жертв чумы, погребенными в общей могиле под Лондоном, и эти кости пролежали в сырой земле сотни лет, а потому находящаяся на них бактериальная ДНК оказалась сильно фрагментированной под влиянием окружающей среды. Как отмечают авторы в комментарии для издания The Scientist, только 0.0001% ДНК, обнаруженной в этих костях, относилась к чумной палочке. Все остальное было остатками самого разнообразного генетического материала из почвы. Для извлечения искомой молекулы исследователи применили метод, ранее давший результаты для анализа митохондриальной ДНК неандертальца.

Авторы использовали короткие цепочки ДНК, подходящие к определенным участкам генома современной чумной палочки Yersinia pestis, для того, чтобы проверить, не подходят ли они таким же образом к кусочкам ДНК на зубах и костях жертв Черного мора, или, как говорят ученые, не являются ли эти фрагменты ДНК комплементарными. В случае совпадения должны образовываться устойчивые двухцепочечные последовательности. В результате всех необходимых манипуляций ученые остались с коротенькими обрывками бактериальной ДНК, которые они соединили друг с другом, воссоздав небольшую кольцевую молекулу, плазмиду, которой мог располагать штамм чумной палочки, вызвавший Средневековые эпидемии. Сопоставив эту плазмиду с геномом современного возбудителя чумы, они не обнаружили ни одного совпадения, что навело их на мысль о том, что прежнего штамма больше нет. К тому же обычно плазмиды несут гены, указывающие на степень вирулентности заболевания. Однако воспроизведенная кольцевая ДНК-ковая структура не выявила какого-либо гена, которым можно было бы объяснить катастрофическую смертность от чумы в Средние века. Эксперты не исключают, что вирулентность возбудителя может определяться и другими частями генома. А может быть и так, что средневековая смертность была связана не столько с особой вирулентностью возбудителя, сколько с полным отсутствием здравоохранения как такового и полной антисанитарией. Напомню, что возбудителя чумы переносят блохи, паразитирующие на крысах, которых, как считает известный микробиолог и популяризатор науки Дэвид Кларк (David P.Clark), в городах гораздо больше, чем людей.