Проект Биоразнообразие Пупка принес первые результаты - Гранит науки - 2011-07-18

Проект Биоразнообразие Пупка (Belly Button Biodiversity Project) принес первые результаты – анализ ДНК микрофлоры из 95 пупков выявил более 1400 бактериальных штаммов.

Проект, инициированный учеными Университета Северной Каролины (North Carolina State University) и призванный всего лишь привлечь интерес публики к микробиологии, обернулся исследованием с серьезными научными перспективами. 662 бактериальных штамма из тех, что были обнаружены в человеческих пупках, оказались совершенно новыми для науки, ученые даже не знают, к какому семейству отнести эти микробы. Микробную флору сейчас, как правило, определяют по гену, кодирующему определенную рибосомальную РНК (16S rRNA), поскольку этот ген – один из наименее изменчивых генов. А потому систематическое положение организма и время расхождения с близкими видами могут быть определены на основании анализа сходств и различий в последовательностях этого гена. Он же был ключевым в идентификации бактерий пупка. Материал для исследования собирали у себя добровольцы – сотрудники Университета Северной Каролины и участники различных научных мероприятий, проводимых университетом. Были среди добровольцев и научные журналисты, авторы таких изданий как New Scientist и Discover. У одних в пупке не оказалось ничего, достойного внимания микробиологов, у других, напротив, разнообразие и экзотика, например, бактерия под названием Georgenia, прежде известная как исключительно почвенный обитатель, причем, японский. Но, как отмечает Popular Science, носитель этого микроба в своем пупке никогда даже не был в Японии.

Несмотря на предполагаемое количеством пупочных бактериальных штаммов разнообразие, 80% этого микробиома представлены всего 40 видами. Но это среднее число. А, например, в пупке обозревателя Discovery и писателя Карла Циммера (Carl Zimmer) бактериальных видов оказалось 53, 35 из них присутствовали еще только у 10 добровольцев-участников исследования, но 17-ти не было ни у кого больше. Ученые ограничили анализ ДНК только бактериями, исключив из этого исследования грибы и другие микроорганизмы, а также вирусы. Ген рибосомальной РНК, по которому определялись бактерии путем сравнения его последовательности с миллионами имеющихся в базах данных по ДНК, служит, как уже отмечалось, для установления эволюционного родства между видами. Однако, как считают специалисты, различия по одной только этой последовательности могут быть столь незначительны, что если перевести это в масштаб млекопитающих, то собаки и кошки окажутся в одном таксономическом подразделении. Поэтому идентификация новых бактерий – это отдельное трудоемкое занятие. По мнению ученых, сейчас, уже на самых начальных стадиях реализации проекта биоразнообразия пупка, стало ясно, насколько несведущи мы в том, что касается микробного разнообразия разных сред обитания.