Бесплатный пакет программного обеспечения для минимизации рисков синтетической биологии разработан в Технологическом Институте и Университете Виргинии - Гранит науки - 2011-04-07
Бесплатный пакет программного обеспечения для минимизации рисков синтетической биологии разработан в Технологическом Институте и Университете Виргинии (Virginia Tech).
Virginia Tech запатентовал пакет программ под названием GenoTHREAT, который позволяет обнаруживать использование синтетической ДНК агентами биотерроризма. Этот общедоступный программный продукт создан в Институте Биоинформатики Virginia Tech (Virginia Bioinformatics Institute at Virginia Tech) по гранту Национального Научного фонда (National Science Foundation) как инструмент, рекомендованный федеральным правительством для минимизации риска получения опасных биологических материалов злонамеренными людьми. Размер гранта составил 99 819 долларов. Процесс скрупулёзного биоинформатического анализа, который выполняет созданный программный пакет, описан в мартовском номере Nature Biotechnology.
Авторы публикации – студенты Virginia Tech под руководством профессора Жана Пеко (Jean Peccoud), по словам которого, «это было вполне естественно – начать разработку пакета GenoTHREAT в контексте федерального надзора, осуществляемого в области синтетической биологии». Имеются в виду деятельность специальной биоэтической комиссии при Белом доме и дебаты в Конгрессе, посвященные вопросам этики и безопасности нового научного направления. Они возникли в мае прошлого года сразу после того как Институт Крейга Вентера (J.Craig Venter Institute) объявил о создании первой искусственной живой клетки.
За прошлогодним объявлением, по сути, стояло лишь успешное функционирование искусственно созданного бактериального генома в бактериальной же клетке, тем не менее, этот прецедент стал знаменем быстро развивающейся синтетической биологии.
Программное приложение GenoTHREAT анализирует последовательности ДНК, заказываемые компаниям, которые выполняют генный синтез, на предмет присутствия в получаемых фрагментах потенциально вредоносных последовательностей, способных кодировать опасные комбинации ДНК или даже организмы.
Пакет программ рекомендован к использованию не только синтезирующими компаниями, но и теми, кто заказывает синтетические ДНК или имеет дело с биоинформатическими ресурсами. Этой программой можно также анализировать данные, полученные при прочтении геномных последовательностей из неизвестных источников.