Завершен международный проект по расшифровке генома крупного рогатого скота - Гранит науки - 2009-04-28

Завершен международный проект по расшифровке генома крупного рогатого скота - 300 исследователей из 25 стран сообщают о первых результатах анализа нового генома в журнале Science (24 April, 2009).

Шестилетний проект по расшифровке завершился, но началась работа по выявлению генетических вариаций между представителями разных пород коров. Два международных консорциума, Консорциум по расшифровке и анализу коровьей последовательности ДНК (Bovine Sequencing and Analysis Consortium) и Консорциум по выявлению комбинаций генетических маркеров в индивидуальных коровьих геномах (Bovine HapMap Consortium) опубликовали в одном номере Science две статьи. В одной представлены результаты семикратного перечитывания генома одной коровы Герефордской породы (по кличке Доминетта, L1 Dominette 01449) , а во второй - генетические вариации, установленные у сотен коров 19 пород. Эти данные проливают свет на эволюцию коров, но также позволяют выявить генетические основы таких важных сельскохозяйственных признаков как жизнеспособность и устойчивость к заболеваниям, мясная и молочная продуктивность. Помимо очевидных прикладных достоинств публикуемых результатов, геном коровы позволяет по-новому взглянуть на геном человека. Оказалось, что организация генома человека имеет гораздо больше сходства с организацией генома коровы, чем с организацией геномов крыс или мышей.

На 29 парах хромосом и одной Х-хромосоме коровы Доминетты находится 22 тысячи генов, кодирующих белки, около 500 микроРНК, которые играют регуляторную роль, а также повторяющиеся последовательности ДНК, специфические для жвачных. Всего 2.87 миллиардов пар оснований. «Жвачные фрагменты» ДНК занимают в геноме коровы около 27%. Сравнивая геном коровы с геномами человека, собак, мышей, крыс, опоссума и утконоса, авторы выявили 14 345 групп ортологичных генов, общих для коров и других млекопитающих. Ортологичные гены – это одинаковые (гомологичные) гены, у родственных организмов, которые разошлись в ходе эволюции. Обнаружены также 1 217 ортологичных групп, общих только для плацентарных млекопитающих. В ходе эволюции коровий геном претерпел ряд реорганизаций, которые, в частности, привели к дупликации (т.е. удвоению) генов, связанных с функциями иммунитета, обоняния, репродукцией, лактацией и пищеварением. В финансировании проекта генома крупного рогатого скота принимали участие федеральные органы США, правительства Канады, Австралии, Норвегии и ряда других стран. Общая стоимость проекта не раскрывается.