Биоинформатика показала, что бактерия, вызывающая язву желудка, сопровождает человека с доисторических времен - Гранит науки - 2007-02-18

У микрофона Марина Аствацатурян! В последнем номере журнала Nature представлено исследование англо-германской группы ученых, которые, используя компьютерное моделирование и методы вычислительной биологии, пришли к выводу о том, что всем известная Helicobacter pylori и человек вышли из Африки вместе. Как отмечают авторы, «бактерия оставалась тесно связанной с человеческой популяцией с тех самых пор», по их подсчетам, примерно 58 тысяч прошедших лет. По словам одного из исследователей, доктора Франсуа Балу (Francois Balloux) из Кембриджского Университета (Cambridge University), эта работа «не только указывает на страдания нашего предка от язвенной бактерии на протяжении десятков тысячелетий, но и открывает возможности для понимания ранней миграции человека». Английские ученые в сотрудничестве с коллегами из Института Инфекционной Биологии Макса Планка (Max Planck Institute for Infection Biology) в Берлине сопоставили данные о распространении ранних людей из Восточной Африки по всему свету с таковым микроба Helicobacter pilory. Ранее было выявлено, что чем дальше удалялся человек от своей колыбели, т.е. от Африки, тем больше он отличался от себя первоначального генетически. И так же, оказалось, обстоит дело с геномом H.pylori.

Совместив генетический анализ с компьютерной моделью, которая предсказывает распространение бактерий по миру, авторы публикации в Nature показали, что возбудитель язвы мигрировал из Восточной Африки в то же самое время, что и человек и шел теми же путями, что и он. Как поясняет доктор Марк Ахтман (Mark Achtman) из берлинского института, между человеком и бактерией можно провести четкие параллели в особенностях изоляции с расстоянием и уменьшении внутривидового разнообразия с удалением от Африки. «Компьютерные симуляции указывают на сопоставимое время исхода из Африки человека и микроба». Эти биоинформатические исследования подтверждают предположения врачей-гастроэнтерологов относительно того, что Helicobacter pylori эволюционировала вместе с человеком. Напомню, что на эту бактерию как на первопричину язвенной болезни указали в 1982 году австралийские ученые Робин Уоррен (Robin Warren) и Барри Маршалл (Barry Marshall), за что в 2005 им была присуждена Нобелевская премия по физиологии-медицине. До этого открытия считалось, что язва – это болезнь исключительно образа жизни. И теперь встает вопрос – если эта бактерия с человеком так давно, то почему сама болезнь выявилась относительно недавно? Еще одна «язвенная» реминисценция – в прошлом году тот же доктор Ахтман с коллегами путем сравнения двух видов Helicobacter, установили, что около 200 тысяч лет назад человек каким-то образом передал эту бактерию кошачьим.