Последовательность ДНК древнего предка всех млекопитающих восстанавливает компьютерная программа - Гранит науки - 2004-12-01

Последовательность ДНК древнего предка всех млекопитающих восстанавливает компьютерная программа – о виртуальной реализации амбициозного научно-фантастического проекта подобного кинематографическому «Парку Юрского периода» американские ученые сообщили в журнале Genome Research

У микрофона Марина Аствацатурян! Общий предок всех плацентарных млекопитающих жил около 80 миллионов лет назад, и собрать его геном, т.е. вывести всю генетическую последовательность такого организма, оказалось возможным с развитием компьютерных технологий, но не молекулярной генетики, которая в случаях материала старше 50 тысяч лет пока бессильна. Дэвид Хаусслер (David Haussler), работающий под эгидой Медицинского Института Говарда Хьюза (Howard Hughes Medical Institute) в Калифорнийском Университете Санта Круз (University of California at Santa Cruz), вместе с коллегами написали компьютерную программу, которая моделирует эволюцию ДНК у различных линий млекопитающих. Сначала они снабдили ее информацией об участке генома под названием локус CFTR – это хорошо изученная медицинскими генетиками область, связанная с рядом заболеваний, в частности, с муковесцидозом. И последовательность CFTR известна не только для человека, но и для свиньи, лошади, кошки, собаки, мыши, летучей мыши, кролика, гориллы и шимпанзе. Программа нацелена на выявление изменений как по индивидуальным нуклеотидам, так и по последовательности ДНК внедренной или, напротив, утраченной.

По мере усовершенствования программы ученые добились реконструкции выделенного локуса у прародительницы всех плацентарных млекопитающих. Точность реконструкции последовательности ДНК оценивается в 98 процентов. Прежде никаких представлений о том, что являл собой всеобщий предок на генетическом уровне, не было – сказал в интервью сетевому ScientificAmerican.com один из авторов работы Расмус Нильсен (Rasmus Nielsen) из Корнельского Университета (Cornell University). Для восстановления всего генома предка млекопитающих, который был маленьким шерстистым ночным существом, нужна полная генетическая информация о большем количестве разных животных. В настоящее время полные геномы есть только для пяти млекопитающих, по подсчетам Хаусслера необходимо еще 15 геномов, и тогда можно будет отследить молекулярную эволюцию нашей ДНК на 75 миллионов лет назад.