Гранит науки - 2004-07-18

Первый 'черновик' генома собаки появился в свободном доступе в базе данных, которой пользуются исследователи в области биомедицины и ветеринарии по всему миру Сообщает об этом Национальный Институт Исследований Генома Человека (National Human Genome Research Institute) США

Геном домашней собаки Canis familiaris составила группа под руководством Керстина Линдблада-То (Kerstin Lindblad-Toh) из Массачусетского Технологического Института (Broad Institute of MIT) и Agencourt Bioscience Corp. Для расшифровки последовательности собачьей ДНК выбрали из 60 разных пород одну, боксера, который отличается наименьшей изменчивостью генома и следовательно даст наиболее надежные данные о нем. Первичная последовательность ДНК рыжего с белой грудью пса по кличке Таша была проверена семь раз, и окончательный результат представлен там, где собраны все уже расшифрованные геномы, например, в базе данных Национального Центра Биотехнологической Информации при Национальных Институтах Здоровья (NIH's National Center for Biotechnology Information) под названием GenBank (http://www.ncbi.nih.gov/Genbank).

В настоящее время идет сравнение расшифрованных геномов собаки и человека, и результаты сравнительного анализа ожидаются в ближайшие месяцы. По размерам геном собаки близок геномам человека и других млекопитающих, он содержит около 2.5 миллиардов пар оснований ДНК. В результате долгой истории селективного скрещивания, многие типы собак стали подвержены генетическим заболеваниям, но это те заболевания, которые трудно изучать у людей - такие сложные болезни как рак, заболевания сердца, глухота, слепота и аутоиммунные нарушения. К тому же собака - хорошая модель для изучения генетики поведения, и известна незаменимая роль собак в фармакологических испытаниях. Для того, чтобы лучше охарактеризовать ту или иную собачью болезнь, необходимо иметь достаточное количество маркеров в полученном геноме, меток, различимых специалистами по молекулярной генетике. А потому в дополнение к боксеру расшифровываются еще 9 собачьих пород, 4 разновидности волка и койот. И уже сейчас выявлено около 600 тысяч точечных различий, так называемых однонуклеотидных полиморфизмов - в первом приближении по одному такому полиморфизму на каждые 5 тысяч пар оснований ДНК. Работа по расшифровке генома собаки началась в июне 2003 года.