Гранит науки - 2004-03-08

1800 новых видов микробов и 1 миллион 200 тысяч генов удалось выявить в Саргассовом море группе под руководством всемирно известного расшифровщика геномов американского ученого Крейга Вентера (Craig Venter) О старте 9-миллионного проекта Вентера по молекулярно-генетическому исследованию не имеющего берегов Саргассова моря, которое считалось "плавающей посреди Атлантического океана пустыней", наша программа сообщала в мае прошлого года. Таким образом миф о скудности биологического разнообразия этой уникальной экосистемы Вентер с коллегами развенчали всего за 10 месяцев. Статья об этом появилась в он-лайновой версии журнала Science в минувшую пятницу, и тогда же состоялась приуроченная к публикации встреча ученых из Мериленда с журналистами. Как пишет Washington Post, "совместив 2 свои страсти науку и мореплавание, Вентер взял исследовательскую команду и отправился на Бермуды для того, чтобы найти подтверждение идее о том, что океан полон микробной жизни", которую, однако, трудно выявить и тем более изучать в лаборатории. Подход Вентера был, как это свойственно независимому исследователю, радикален. Применяемая им анализирующая ДНК система работает, разрезая весь обнаруженный генетический материал на маленькие кусочки, затем она "прочитывает" каждый кусочек, а потом как бы сшивает все отрезки обратно воедино. Но последний этап выполняется виртуально, его делает компьютер. Задача соединения всех фрагментов генетической информации в правильном порядке достаточно сложна и в случае отдельного организма будь то человек или плодовая мушка дрозофила. Но когда речь идет об образцах, содержащих ДНК из тысяч или миллионов организмов, требуется мощнейшая вычислительная техника и такой же математический аппарат.

Компьютерный анализ ДНК из образцов Саргассова моря, взятых в 6 разных местах, показал, что генетический материал принадлежит 53 тысячам видов бактерий, 1800 из них совершенно новые для науки и у них обнаружены новые гены. Около 800 новых генов кодируют так называемые фоторецепторные белки, что обогащает сведения о бактериях, способных преобразовывать свет в другие виды энергии. Проект по Саргассову морю финансируется Департаментом Энергии (Department of Energy) США, а Вентер, покинув расшифровавшую геном человека, а на самом деле геном самого Вентера компанию Celera Genomics, сейчас возглавляет исследовательский Институт Биологических Альтернатив в Энергетике (Institute for Biological Energy Alternatives). Таким образом обнаружение новых "энергопреобразующих" генов в малоизученном Саргассовом море оказывается вполне соответствующим поставленным задачам. Некоторые неназванные газетой New York Times океанографы говорят, что в исследовании Вентера недостаточно данных о температуре и солености тех мест Саргассова моря, откуда взяты образцы богатой микробной жизнью воды, и вообще анализируемые им бактерии могут быть следствием загрязнения. Однако эксперты журнала Science ручаются за то, что ученые команды Вентера стояли на страже чистоты исследований в прямом смысле этого слова.