Гранит науки - 2003-11-09

Опубликована первая белковая карта сложного организма на модели плодовой мушки дрозофилы показано, как 7 тысяч белков могут вступать в 20 тысяч различных взаимодействий У микрофона Марина Аствацатурян! Первая в мире белковая карта, сопоставимая по значимости, если не более важная для понимания биологической картины мира, чем карта генома человека, опубликована в конце первой недели ноября 2003 года он-лайновой версией журнала Science. Общее представление о том, как это было сделано путем сопоставления клонированных элементов всех мушиных РНК, считанных с генов (транскриптома дрозофилы), с известными кодирующими участками ее же ДНК, можно найти в свободном доступе в сетевом издании The Scientist. Пионерскую работу по целостному представлению жизни белков в дрозофиле провели американские ученые из биотехнологической компании CuraGen и их коллеги из нескольких университетов. "Новая карта говорит нам о том, как белки "разговаривают" друг с другом и работают в клетке сообща" - заявил в интервью Reuters один из авторов этого краеугольного достижения Джоэль Бейдер, в прошлом сотрудник CuraGen, а сейчас Университета Джонса Хопкинса (Johns Hopkins University) в Балтиморе. Бейдер и его соавторы уже заявляют о том, что добытые на дрозофиле знания используются ими для создания новых лекарств против рака, диабета и сердечно-сосудистых заболеваний. "Знать, из чего состоит клетка человеческого организма недостаточно. Нужно знать, какие ее части работают вместе для выполнения определенных функций внутри клетки. И это приводит к лучшему пониманию наследственных болезней" - отмечает Бейдер.

В отличие от геномной карты, которая является набором сведений о составе ДНК, но мало что говорит о работе зашифрованных ею генов, белковая карта - это более реальный путеводитель по белковому миру, форма которого, как мы знаем по высказыванию классика марксизма-ленинизма, есть отражение жизни. Белки это и стройматериал клеток, и запускающие многие механизмы ферменты, и сигнализирующие о том или ином процессе в организме молекулы. Белков больше, чем генов. У человека 250 тысяч протеинов на 30 тысяч генов. И эти десятки тысяч белков взаимодействуют друг с другом в бесчисленных комбинациях. У плодовой мушки Drosophila melanogaster по новой карте 7 тысяч белков, и с помощью соответствующих компьютерных программ между ними выявлено 20 тысяч взаимодействий. Многие из белков дрозофилы схожи с белками человека, подобны и кодирующие их гены, например, ген BCL6, он одинаков и у дрозофилы, и у человека, только у нас мутации по нему определяют развитие определенного вида лимфомы. С появлением карты белковых взаимодействий поиск лекарств, которые способны воспрепятствовать работе ансамбля приводящих к заболеванию белков, становится прицельным. Но данные о белковых взаимодействиях у человека, которыми компания CuraGen, судя по всему, располагает, публиковать она пока не намерена.