Гранит науки - 2003-04-14
Расшифрована генетическая последовательность вируса, предположительно вызывающего серьезный острый дыхательный синдром или атипичную пневмонию У микрофона Марина Аствацатурян! Работа, завершившаяся на рассвете в прошлую субботу в Онкологическом Агентстве Британской Колумбии (British Columbia Cancer Agency) , что в канадском городе Ванкувере, не обещает скорейшего вакцинирования всего человечества, но дает реальную возможность точной диагностики нового заболевания, которое иногда оказывается смертельным. Расшифровка, проведенная канадскими учеными, подтвердила, что медицина столкнулась с совершенно новым коронавирусом. Аналогичные результаты буквально на следующий день были получены и американскими специалистами из расположенных в Атланте Центров по контролю и предупреждению болезней (Centers for Disease Control and Prevention) пишет Нью-Йорк Таймс. По словам представителя ВОЗ Дика Томпсона (Dick Thompson), которые приводит издание, "скорость, с которой была расшифрована последовательность генома этого вируса, ошеломляет". Коронавирус как наиболее вероятный возбудитель серьезного острого дыхательного синдрома (severe acute respiratory syndrome, SARS) был выявлен всего лишь 3 недели назад. "Не забывайте, что на обнаружение вируса, порождающего СПИД, ушло несколько лет. Сотрудничество ученых на пути идентификации возбудителя серьезного острого дыхательного синдрома просто колоссально" - отметил Томпсон.
Пробная идентификация возбудителя атипичной пневмонии была проведена уже во время вспышки заболевания в марте в Калифорнийском Университете Сан-Франциско (University of California in San Francisco). Для начала раствор с фрагментами нуклеиновой кислоты, выделенной из материала, взятого у пациентов с атипичной пневмонией (нуклеиновая кислота содержит генетическую последовательность), помещали на стеклянную пластину с ячейками. Сверху - для обнаружения сходства между различными генетическими последовательностями по химическим связям, которые должны образоваться исходя из структуры нуклеиновых кислот, - помещали образцы одной тысячи вирусов, имеющих разную степень родства с коронавирусами, найденными у индюков и коров. Вирус атипичной пневмонии оказался отличным от коронавирусов индюков, коров и мышей, но все-таки коронавирусом нового, четвертого типа. Для вирусов эта последовательность очень велика 29 тысяч 736 пар оснований нуклеотидов условно-буквенных единиц, в которых измеряются молекулы наследственности ДНК или РНК. Обычно геном вируса содержит несколько тысяч нуклеотидных оснований, тогда как у бактерий их миллионы, у человека 3 миллиарда. Самой кропотливой работой, по словам руководителя канадских исследований доктора Марко Марра, было перевести последовательность вирусной РНК в пригодную для расшифровки в специальном приборе ДНК. Ученые работали, не выходя из лаборатории сутки напролет, всю последнюю неделю, живя на одной газировке, пицце и пончиках - пишет Нью-Йорк Таймс. Полученная последовательность уже есть в свободном доступе в Интернете, там же должна появиться и последовательность из американских Центров. От последовательности до надежного теста на атипичную пневмонию один шаг.